2062年，為了軌道電梯的所有權(quán)，地球分為兩大陣營而互相爭奪；主角桂木桂隸屬的自由宇宙軍，計(jì)劃以新研發(fā)的D兵器“時(shí)空震動彈”破壞軌道電梯的能源供應(yīng)，但是行動遭遇到敵對陣營的猛烈炮火而不得不撤退，危急中怒火中燒的桂木桂，啟動了尚未調(diào)整好的時(shí)空震動彈，結(jié)果引發(fā)了始料未及的時(shí)空混亂，造成多元世界同時(shí)出現(xiàn)互相混合，并形成了“相克界”，桂木桂也因此被卷入震波而時(shí)空轉(zhuǎn)移，來到了事件發(fā)生的20年后的混亂時(shí)空世紀(jì)20年。
　　桂木桂被埃曼人（エマーン）的商隊(duì)尋獲并一同行動，但是桂木桂卻由于身為修復(fù)混亂時(shí)空的關(guān)鍵“特異點(diǎn)”，因而成為各勢力爭奪的目標(biāo)；在不斷戰(zhàn)斗與尋求解決之道的同時(shí)，桂木桂官校的同窗歐森竟然出現(xiàn)在眼前，并且與他兵戎相見；甚至還見到了自己未來的女兒雅典娜。桂木桂最終將面對新舊交雜的世界，并試圖修復(fù)時(shí)空混亂的局面。而桂木桂終于發(fā)現(xiàn)，要想讓時(shí)空回歸正軌的最后手段，竟是得前往當(dāng)初時(shí)空震動彈啟動前那一刻的時(shí)空中，并殺死當(dāng)時(shí)的自己…